34047007@qq.com
5b9fcff82e
- 随机抽样 1000 篇有 mesh_headings 的文献 - 将 JSONB 中的 major=true 与 global_literature_tag.is_major 交叉验证 - 报告漏标率（false negative）和误标率（false positive） 运行结果（sample=1000）： 漏标率：0.1% 误标率：0.0% Major Topic 数据质量良好，无需修复 pipeline
SciLit Oncology — 肿瘤科文献管理平台
快速启动
# 1. 启动所有服务
docker compose up -d
# 2. 初始化数据库（首次）
docker compose exec backend alembic upgrade head
# 3. 访问
# 前端: http://localhost:5173
# 后端 API: http://localhost:8000/docs
# MinIO 控制台: http://localhost:9001 (minioadmin/minioadmin)
项目结构
backend/
├── app/
│ ├── main.py # FastAPI 入口
│ ├── config.py # 配置
│ ├── db.py # 数据库连接
│ ├── core/ # 核心：安全、权限、多租户中间件
│ ├── models/ # SQLAlchemy 模型 (32 张表)
│ ├── schemas/ # Pydantic 请求/响应
│ ├── api/v1/ # REST API 端点
│ └── tasks/ # ARQ 异步任务 (PubMed 管道)
├── alembic/ # 数据库迁移
└── config/specialties/ # 科室配置 (oncology.yaml)
frontend/
├── src/
│ ├── views/public/ # 公开页面 (无需登录)
│ ├── views/auth/ # 登录/注册
│ ├── views/app/ # 已登录应用页面
│ ├── stores/ # Pinia 状态管理
│ ├── api/ # Axios 封装
│ └── router/ # Vue Router
docs/ # 完整设计文档 (9 份)
技术栈
- 后端: FastAPI + SQLAlchemy 2.0 (async) + PostgreSQL 16 + Redis + Elasticsearch
- 前端: Vue 3 + Naive UI + Pinia + Vite
- 任务队列: ARQ
- 文件存储: MinIO / S3
- 多租户: PostgreSQL RLS + ContextVar 双层隔离
文档
详细的产品规划、数据库设计、标签体系、数据管道、UI 设计见 docs/ 目录。